Autor: Anviatella (25 de febrero, 2008) VistaHondaPuenteNavarro.jpg. Recuperado el 17 de junio del 2015, de https://commons.wikimedia.org/wiki/File:VistaHondaPuenteNavarro.jpg
Habitada en épocas precolombinas por Ondaimas y Gualies, de la familia lingüística del Caribe, fue llamada en un principio Villa de San Bartolomé de Honda, y fundada por Francisco Núñez Pedroza. Durante la colonia, fue el puerto fluvial que conectaba a Bogotá con el río Magdalena, respondiendo a las necesidades comerciales del momento.
Durante la fundación de la ciudad, se tomó como referencia el asentamiento indígena que había en el lugar, por lo cual, desde la historia, se habla de «descubrimiento» y no de «conquista».
En 1805, la ciudad fue víctima de un terremoto que destruyó gran parte de las edificaciones. El 22 de diciembre de 1814, se proclamó en ella la independencia del «Estado de Mariquita», territorio del que era capital, decretando que sólo aceptaría gobiernos de elección popular. Sin embargo, en 1816 se dio la reconquista de la ciudad, vinculándola de nuevo al control de la corona.
La ciudad vivió su furor económico colonial por la cercanía del río Magdalena; más tarde, en el siglo XIX, volvió a vivir el auge, después de un periodo bajo, por el reavivamiento del río gracias a las máquinas de vapor. En la actualidad, la pesca es uno de los fuertes económicos de la ciudad.